Il se marie le 5 novembre 1892 avec Marthe Deloye en l’église St Sulpice à Paris, ses deux témoins sont ses deux maîtres des Beaux-Arts : Jules Joseph Lefebvre et Jean-Joseph Benjamin-Constant.

Les mariés partent en voyage de noces en Toscane, notamment à Florence. Il se familiarise avec les grandes fresques de la Renaissance italienne.

En 1895, il rencontre Puvis de Chavannes et présente alors son travail à la société nationale des Beaux-Arts notamment les nombreuses aquarelles réalisées en Italie pendant son voyage de noces.

En 1897, Auburtin étudie la faune et la flore sous-marine aux aquariums de Roscoff et de Banyuls, d’où il rapporte de nombreux croquis qui lui permettront de réaliser en 1898 « le fond de la mer », grand décor destiné à l’amphithéâtre de zoologie de la Sorbonne.